《基础医学与临床》（CN 11-2652/R, ISSN 1001-6325）的前身为“生理科学”，于1981年创刊，1984年面向全国公开发行，1990年正式更名为“基础医学与临床”。本刊由北京市科学技术协会主管，北京生理科学会主办，中国医学科学院基础医学研究所和北京协和医院共同承办、编辑出版，自2005年起改为月刊，主要刊登基础医学和临床医学的研究论文、短篇研究报道、新的实验技术与方法、基础与临床学科发展前沿的短篇综述、高等医学教育有关论文、罕见的临床病例分析等。
《基础医学与临床》是以基础研究与临床实践相结合为主要宗旨的医学综合性期刊。多年来，本刊在催化医学研究新观念的形成，扩展from bench to bedside内涵，促进由临床实践中提出科学问题、经实验室基础研究、再将研究成果反哺临床工作、解决临床实际问题的良性循环过程不断向纵深发展等方面发挥了积极作用，对我国开展转化医学研究（translational medical research）起到了重要作用。
《基础医学与临床》为中国科技核心期刊，收录于万方、知网、维普等主要数据库，列于国家卫生健康委员会专业技术资格评审主要期刊目录、中国科技论文统计源期刊、中国学术期刊影响因子年报统计源期刊、中国科学引文数据库来源期刊、中文核心期刊遴选数据库、中国期刊网全文数据库、中国科技期刊全文数据库等。2004年入选《中国科技期刊科技精品数据库》。2006年-2008年入选中国科协精品科技期刊工程资助项目（C类），获得国家级科技期刊奖励基金。
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